咽拭子通常指拿一根长的棉签从咽后壁采集鼻咽部分泌物的一种检测方法，是检查病原微生物的一种手段，并且可以结合其他的一些检查结果，比如X光透视、CT等，诊断呼吸道感染部位，正常人咽峡部培养应该有口腔正常菌群，而没有致病菌的生长。
咽部的细菌主要来自外界，正常情况下不致病，但在机体全身或局部抵抗力下降的情况下可以出现感染等而导致疾病，因此咽拭子培养能够分离出致病菌。
从咽部和扁桃体取分泌物做细菌培养或病毒分离，就是一种咽拭子的检查，咽拭子分泌物中检测出致病菌则应视为呼吸道感染，常见的致病菌有葡萄球菌、肺炎双球菌、流感嗜血杆菌、肺炎克雷白杆菌、大肠杆菌等。
如果培养出结核杆菌则为肺结核，培养出酵母菌则考虑真菌感染。通常情况下做的咽拭子检测有在流感疾病中、新型冠状病毒感染的疾病中、支原体感染这些常见的病原体感染中都有应用，应该根据咽拭子的检查结果辅以临床的治疗。
咽拭子和鼻拭子哪个准
咽拭子和鼻拭子都是相对准确的。
咽拭子和鼻拭子的检测一般并没有相比性，不管咽拭子还是鼻拭子，都是检测病毒和细菌的测试取样手段，用于诊断呼吸系统的某些感染。他们的检测方法步骤几乎是相同的，只不过鼻拭子是对鼻部的分泌物进行测试，而咽拭子是对咽部的分泌物。常规筛查是咽拭子，但是一部分人觉得咽部经常进食、饮水，本身的分泌物比较少，而鼻腔的分泌物比较多，比较好取标本，临床中也会加测鼻拭子。
